ΚΗΥ ΕΜΠ – ΠΑΡΟΥΣΙΑΣΗ ΚΑΙ ΤΕΧΝΙΚΕΣ ΑΠΟΔΟΤΙΚΗΣ ΧΡΗΣΗΣ ΤΟΥ ΕΘΝΙΚΟΥ ΥΠΕΡΥΠΟΛΟΓΙΣΤΙΚΟΥ ΣΥΣΤΗΜΑΤΟΣ ARIS

Europe/Athens
ΔΕΠΥ Α (ΚΗΥ)

ΔΕΠΥ Α

ΚΗΥ

Κέντρο Ηλεκτρονικών Υπολογιστών, Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο, Αίθουσα ΔΕΠΥ Α, Πολυτεχνειούπολη Ζωγράφου (Πληροφορίες: http://www.central.ntua.gr, χάρτης: http://tinyurl.com/hh49ujr).
Description

Το Εθνικό Δίκτυο Έρευνας και Τεχνολογίας (ΕΔΕΤ Α.Ε.), σε συνεργασία με το Κέντρο Ηλεκτρονικών Υπολογιστών (ΚΗΥ) του Εθνικού Μετσόβιου Πολυτεχνείου (ΕΜΠ), διοργανώνει στις 25 Οκτωβρίου 2016 ημερίδα και εκπαιδευτικό σεμινάριο με θέμα «Παρουσίαση και Τεχνικές Αποδοτικής Χρήσης του Εθνικού υπερ-υπολογιστικού συστήματος ARIS - hpc.grnet.gr». Η εκδήλωση θα πραγματοποιηθεί στην αίθουσα ΔΕΠΥ Α του ΚΗΥ.

Η ημερίδα και το σεμινάριο απευθύνεται σε υπάρχοντες και δυνητικούς χρήστες υπερυπολογιστικών συστημάτων και εφαρμογών. Έμφαση θα δοθεί σε εφαρμογές από το χώρο της υπολογιστικής μηχανικής με άμεσο ενδιαφέρον για τις ερευνητικές δραστηριότητες των φοιτητών και του ακαδημαϊκού προσωπικού του ΕΜΠ.

Η συμμετέχοντες θα ενημερωθούν για την υπερυπολογιστική υποδομή ARIS (Advanced Research Information System), και για τις δυνατότητες αξιοποίησής της, ενώ θα έχουν τη δυνατότητα άμεσης πρακτικής εξάσκησης στο σύστημα (hands-on). Οι συμμετέχοντες θα έχουν τη δυνατότητα αν επιθυμούν να τρέξουν δικούς τους κώδικες στο σύστημα (bring your own code) ώστε να αποκτήσουν μια άμεση εικόνα του τρόπου χρήσης και των δυνατοτήτων του.

Στο τελευταίο μέρος της ημερίδας, θα δοθεί η δυνατότητα στους υφιστάμενους χρήστες από το ΕΜΠ να συζητήσουν με την ομάδα υποστήριξης της ΕΔΕΤ για τα προβλήματα που έχουν αντιμετωπίσει έως τώρα με τη χρήση του συστήματος, ενώ θα δοθούν κατευθυντήριες γραμμές για την καλύτερη εκμετάλλευση της εθνικής αυτής υποδομής.

Θεματικές Ενότητες

Τα θέματα που θα καλυφθούν κατά τη διάρκεια της Ημερίδας είναι:

  • Αρχιτεκτονική και τεχνολογία του υπερυπολογιστικού συστήματος ARIS
  • Πολιτική Πρόσβασης στο εθνικό υπερυπολογιστικό σύστημα ARIS. Προσκλήσεις έργων και αξιολόγηση
  • Η ευρωπαϊκή υποδομή PRACE και η δυνατότητα χρήσης της. Βέλτιστες πρακτικές για πρόσβαση στα ευρωπαϊκά συστήματα.
  • Πρόσβαση και χρήση της υποδομής ARIS. Παραδείγματα χρήσης, συνηθισμένα προβλήματα και καλές πρακτικές.
  • Εκτέλεση εφαρμογών MPI και OpenMP
  • Profiling και benchmarking εφαρμογών.

Το σεμινάριο είναι μέρος της στρατηγικής του ΕΔΕΤ για την προσφορά εκπαίδευσης και κατάρτισης στον τομέα των υπερυπολογιστικών υποδομών και των επιστημονικών εφαρμογών μεγάλης κλίμακας, σε όλη την Ελληνική ακαδημαϊκή και ερευνητική κοινότητα.

Πρακτικές πληροφορίες

Για την αποδοτική παρακολούθηση της ημερίδας, οι συμμετέχοντες θα πρέπει να έχουν γνώσεις χρήσης του λειτουργικού συστήματος Linux, ενώ χρήσιμες θα είναι βασικές γνώσεις σε αρχές προγραμματισμού και μεθόδους παράλληλης επεξεργασίας.

Η συμμετοχή στην ημερίδα είναι δωρεάν. Λόγω περιορισμένου αριθμό θέσεων και για διευκόλυνση της διοργάνωσης, όσοι ενδιαφέρονται να την παρακολουθήσουν, θα πρέπει να εγγραφούν χρησιμοποιώντας τη φόρμα στον σύνδεσμο: http://goo.gl/forms/YkpzYu2hqh


 

Χώρος Εκδήλωσης

Κέντρο Ηλεκτρονικών Υπολογιστών, Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο, Αίθουσα ΔΕΠΥ Α, Πολυτεχνειούπολη Ζωγράφου (Πληροφορίες: http://www.central.ntua.gr, χάρτης: http://tinyurl.com/hh49ujr).

Πρόγραμμα Εκδήλωσης

09:00 – 09:15 Έναρξη-Χαιρετισμοί

09:15 – 09:45 Παρουσίαση υπερυπολογιστικής υποδομής ARIS

09:45 – 10:00 Παρουσίαση ΚΗΥ και υπολογιστικών υποδομών ΕΜΠ

10:00 – 10:30 Πολιτική́ Πρόσβασης στο σύστημα ARIS - Διαδικασίες και βέλτιστες πρακτικές πρόσβασης στα Ευρωπαϊκά́ υπερυπολογιστικά συστήματα

10:30 – 11:00 Διάλειμμα

11:00 – 12:00 Εργαλεία και τρόποι χρήσης του συστήματος

12:00 – 14:00 Συζήτηση με υφιστάμενους ή εν δυνάμει χρήστες του συστήματος για συγκεκριμένες εφαρμογές, τρόπους χρήσης και βέλτιστες πρακτικές


 

Σχετικά με την υποδομή ARIS

Η υποδομή ARIS αποτελείται από συνολικά τέσσερις νησίδες υπολογιστικών συστημάτων βασισμένους σε αρχιτεκτονική Intel x86 διασυνδεμένους σε ένα ενιαίο δίκτυο Infiniband FDR14 που προσφέρουν πολλαπλές δυνατότητες και αρχιτεκτονικές επεξεργασίας.

  • Μία νησίδα (thin nodes) βασίζεται στην πλατφόρμα IBM NeXtScale και τους επεξεργαστές Intel Xeon E5-2680v2. Διαθέτει 426 υπολογιστικούς κόμβους και προσφέρει συνολικά 8.520 πυρήνες (CPU cores).
  • Μια νησίδα κόμβων μεγάλης μνήμης (fat nodes) που αποτελείται από 44 εξυπηρετητές Dell PowerEdge R820. Κάθε εξυπηρετητής προσφέρει 4 επεξεργαστές Intel Xeon E5-4650v2 και 512 GB κεντρικής μνήμης
  • Μια νησίδα κόμβων επιταχυντών GPU που αποτελείται από 44 εξυπηρετητές Dell PowerEdge R730. Κάθε εξυπηρετητής περιέχει 2 επεξεργαστές Intel Xeon E5-2660v3, 64 GB μνήμης και 2 κάρτες GPU NVidia K40, και
  • Μια νησίδα κόμβων επιταχυντών Xeon Phi που αποτελείται από 18 εξυπηρετητές Dell PowerEdge R730, καθένας εκ των οποίων περιέχει 2 επεξεργαστές Intel Xeon E5-2660v3, 64 GB μνήμης και 2 συνεπεξεργαστές Intel Xeon Phi 7120P.

Επιπλέον, το σύστημα προσφέρει 2 PB αποθηκευτικό χώρο, μέσω του συστήματος αρχείων General Parallel File System (GPFS) της IBM. Η υποδομή ολοκληρώνεται με μια βιβλιοθήκη ταινιών ΙΒΜ TS3500 μέγιστης αποθηκευτικής δυνατότητας περίπου 6 PB.

Σχετικά με την ΕΔΕΤ

Η ΕΔΕΤ Α.Ε. αναπτύσσει και διαχειρίζεται το Εθνικό Δίκτυο Έρευνας & Τεχνολογίας κατά το πρότυπο των αντίστοιχων Ερευνητικών και Εκπαιδευτικών Δικτύων της Ευρωπαϊκής Ένωσης. Παρέχει στην ελληνική ερευνητική και εκπαιδευτική κοινότητα σύγχρονες ηλεκτρονικές υποδομές και υπηρεσίες, με στόχο τη μείωση του ψηφιακού χάσματος και την ισότιμη συμμετοχή των μελών της στην παγκόσμια Κοινωνία της Γνώσης.

Με περισσότερα από 9.000 χλμ οπτικών ινών και σύγχρονο οπτικό εξοπλισμό, διασυνδέει περισσότερους από 100 φορείς, στους οποίους περιλαμβάνονται όλα τα Πανεπιστήμια και ΤΕΙ της χώρας, Ερευνητικά Κέντρα, καθώς και το Πανελλήνιο Σχολικό Δίκτυο, και εξυπηρετεί, σε καθημερινή βάση, περί τους 500.000 χρήστες. Παράλληλα με την παροχή προηγμένων δικτυακών υποδομών και υπηρεσιών η ΕΔΕΤ Α.Ε. παρέχει υπολογιστικές υπηρεσίες Cloud Computing για όλα τα μέλη της ερευνητικής και εκπαιδευτικής κοινότητας. Από τον Ιούνιο του 2015 λειτουργεί το πρώτο εθνικό υπολογιστικό σύστημα υψηλών επιδόσεων (HPC) για την υποστήριξη επιστημονικών εφαρμογών μεγάλης κλίμακας, υποδομή που ενσωματώνεται στο Ευρωπαϊκό οικοσύστημα υπερ-υπολογιστών PRACE.

Για περισσότερες πληροφορίες μπορείτε να επισκεφθείτε τις ιστοσελίδες www.grnet.gr/hpc και http://hpc.grnet.gr

 

Εκπαιδευτές

Γιάννης Λιαμπότης (ΕΔΕΤ): Ο Γιάννης Λιαμπότης είναι διαχειριστής έργων υποδομών στο Εθνικό Δίκτυο Έρευνας και Τεχνολογίας από το 2007. Κατά τη διάρκεια της οκταετούς θητείας του στην ΕΔΕΤ έχει εργαστεί για σειρά έργων, χρηματοδοτούμενων από το 6ο και 7ο Πρόγραμμα Πλαίσιο, για την ανάπτυξη υποδομών και υπηρεσιών HPC, Grid και Cloud. Έχει διατελέσει τεχνικός συντονιστής των έργων SEE-GRID-2, SEE- GRID-SCI and HP-SEE με τα οποία αναπτύχθηκαν υποδομές και υπηρεσίες Grid και HPC στη Νοτιοανατολική Ευρώπη. Σήμερα εκπροσωπεί την Ελλάδα στο Συμβούλιο της Κοινοπραξίας PRACE και είναι μέλος των διοικητικών συμβουλίων ευρωπαϊκών έργων PRACE. Αποφοίτησε από το τμήμα Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Ηλεκτρονικών Υπολογιστών του Εθνικού Μετσόβιου Πολυτεχνείου το 1998 και ακολούθησε μεταπτυχιακές σπουδές στο UMIST, Ηνωμένο Βασίλειο, από όπου αποφοίτησε το 2000.

Δρ. Δημήτρης Ντελλής (ΕΔΕΤ): Ο Δημήτρης Ντελλής είναι κάτοχος Πανεπιστημιακού τίτλου στη Χημεία (1990) και Διδακτορικού Διπλώματος στην Υπολογιστική Χημεία (1995) από το Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών. Διαθέτει σημαντική εμπειρία στην ανάπτυξη υπερυπολογιστικών υποδομών (HPC) και υποδομών υπολογιστικού πλέγματος (Grid). Έχει κάνει χρήση συστημάτων HPC για ερευνητικά έργα στην υπολογιστική χημεία σε υποδομές όπως του FZ-Juelich (J90, T3E, Regata, 2003-2005). Έλαβε υποτροφία από το HPC-Europa για BSC (2009). Στα ευρωπαϊκά έργα EGEE / EGI ενήργησε ως υποστηρικτής των εφαρμογών και διαχειριστής λογισμικού εικονικών οργανισμών, ως διαχειριστής grid sites (HG-02, GR-06), και συνεισέφερε στην εθνική πρωτοβουλία NGI_GRNET από το 2008 έως το 2014. Στα έργα PRACE 1IP / 2ΙΡ / 3IP είχε εμπλακεί σε εργασίες αξιολόγησης, είτε ως μέλος ομάδας ή ως BCO (2010-2014). Σήμερα εργάζεται στην ΕΔΕΤ στη θέση του μηχανικού Υποστήριξης εφαρμογών HPC, και είναι υπεύθυνος για user consultations, porting, optimization και την υλοποίηση εφαρμογών HPC με εθνικούς και διεθνείς πόρους.

Ευάγγελος Φλώρος (ΕΔΕΤ): O κ. Ευάγγελος Φλώρος κατέχει πτυχίο και μεταπτυχιακό δίπλωμα από το Τμήμα Πληροφορικής και Τηλεπικοινωνιών του Εθνικού και Καποδιστριακό Πανεπιστημίου Αθηνών. Διαθέτει μακροχρόνια ερευνητική εμπειρία στον τομέα των κατανεμημένων και παράλληλων πληροφοριακών συστημάτων έχοντας συμμετάσχει σε μεγάλο αριθμό εθνικών και ευρωπαϊκών ερευνητικών έργων σε συνεργασία με το ΕΚΠΑ, το ΕΚΕΦΕ “Δημόκριτος” και το Εθνικό Αστεροσκοπείο Αθηνών. Από το 2008 εργάζεται στην ΕΔΕΤ Α.Ε. ως διαχειριστής έργων ανάπτυξης ερευνητικών υποδομών. Στην ΕΔΕΤ μεταξύ άλλων ήταν υπεύθυνος για το έργο PRACE-GR, το οποίο εγκατέστησε και λειτουργεί την εθνική υπερυπολογιστική υποδομή ARIS (Advanced Research Information System) και επιπλέον συντόνισε εθνικά έργα ανάπτυξης Πράσινων Κέντρων Δεδομένων (Green Data Centers). Μετά την ολοκλήρωση του έργου PRACE-GR έχει αναλάβει την ευθύνη συντονισμού της ομάδας λειτουργίας και διαχείρισης της υποδομής ARIS.

Νικολουτσάκος Νικόλαος (ΕΔΕΤ): Ο Νικολουτσάκος Νικόλαος είναι απόφοιτος του Τμήματος Μηχανικών Ηλεκτρονικών Υπολογιστών & Πληροφορικής του Πανεπιστημίου Πατρών (2014) και μεταπτυχιακός φοιτητής στο ΠΜΣ Επιστήμη και Τεχνολογία Υπολογιστών του ΤμΗΥΠ. Επιστημονικά ενδιαφέροντα και δημοσιεύσεις στο τομέα της παράλληλης επεξεργασίας, προγραμματιστικά μοντέλα MPI, OpenMP, CUDA, OpenCL, Intel LEO. Εργάζεται στην ΕΔΕΤ Α.Ε. στην ομάδα υποστήριξης χρηστών και εφαρμογών του εθνικού υπερυπολογιστικού συστήματος ARIS.

    • 09:00 09:15
      Εισαγωγή 15m
      Έναρξη-Χαιρετισμοί
    • 09:15 09:45
      Παρουσίαση υπερυπολογιστικής υποδομής ARIS
      • Αρχιτεκτονική και τεχνολογία του υπερυπολογιστικού συστήματος ARIS
      Convener: Mr Evangelos Floros (GRNET)
      slides
    • 09:45 10:00
      Παρουσίαση ΚΗΥ και υπολογιστικών υποδομών ΕΜΠ
    • 10:00 10:30
      Πολιτική́ Πρόσβασης στο σύστημα ARIS
      • Πολιτική Πρόσβασης στο εθνικό υπερυπολογιστικό σύστημα
      • Διαδικασίες και βέλτιστες πρακτικές πρόσβασης στα Ευρωπαϊκά́ υπερυπολογιστικά συστήματα
      Convener: Mr Ioannis Liabotis (GRNET S.A.)
      slides
    • 10:30 11:00
      Διάλειμμα 30m
    • 11:00 12:00
      Εργαλεία και τρόποι χρήσης του συστήματος

      Παραδείγματα χρήσης του συστήματος, συνηθισμένα προβλήματα και καλές πρακτικές.

      Convener: Dr Dimitris Dellis (GRNET)
      slides
    • 12:00 14:00
      Συζήτηση με υφιστάμενους ή εν δυνάμει χρήστες του συστήματος για συγκεκριμένες εφαρμογές, τρόπους χρήσης και βέλτιστες πρακτικές

      Πρακτικά παραδείγματα, (Bring your own code)

      Πρακτική χρήση του συστήματος – Συνεργασία με την ομάδα Υποστήριξης Χρηστών,

      Conveners: Dr Dimitris Dellis (GRNET) , Mr Nikos Nikoloutsakos (GRNET)